העיון בחומר ארכיוני בגנזך המדינה מוסדר על-פי חוק הארכיונים והתקנות בדבר עיון בחומר ארכיוני המופקד בגנזך שעודכנו בשנת 2010.

ממשלה

ועדות שרים

כנסת

משרד ראש-הממשלה

משרד החוץ

משרדי ממשלה שונים – חטיבות מיוחדות

משטרת ישראל

ארכיונים אישיים

ממשלה: ישיבות הממשלה
סטנוגרמות של ישיבות הממשלה הזמנית, מאי 1948 – מרץ 1949.
סטנוגרמות של ישיבות הממשלה הראשונה עד הממשלה העשירית, 1949 - 1963. (עד סיום כהונת דוד בן-גוריון)
סטנוגרמות של ישיבות הממשלה אפריל - יוני 1967 (כולל מלחמת ששת הימים).
עותקים כרוכים של ישיבות הממשלה מוצגים באולם הקריאה של הגנזך.

ועדות שרים: ישיבות ועדות שרים
סטנוגרמות של ישיבות ועדת שרים לענייני חוץ וביטחון, 1958-1948
סטנוגרמות של ישיבות ועדת שרים לענייני כלכלה, 1976-1970

כנסת: ישיבות ועדת חוץ וביטחון:
סטנוגרמות של ישיבות ועדת הביטחון וועדת החוץ, 1948 – 1949
סטנוגרמות של ישיבות ועדת החוץ והביטחון, 1949 – 1969 (יוני)
סטנוגרמות של ישיבות ועדת החוץ והביטחון, 1973 (כולל מלחמת יום כיפור)
העיון בסטנוגרמות של ישיבות ועדת החוץ והביטחון של הכנסת נעשה באולם הקריאה של הגנזך.

משרד ראש-הממשלה:
לשכת ראש הממשלה, 1979-1948
לשכת מנכ"ל ראש הממשלה, 1979-1948
הנהלה כללית ושונות, 1975-1948
מזכירות הממשלה, תיקים ענייניים, 1979-1948
המוסד לתיאום, 1960-1948
לשכת היועץ לענייני ערבים, 1979-1950
לשכת סגן ראש הממשלה, אבא אבן, 1953 - 1966

שרים בלי תיק במשרד ראש הממשלה:
לשכת השר נפתלי פרץ, 1959-1955
לשכת השר ישראל גלילי, 1977-1963
לשכת השר גדעון האוזנר, 1977-1964
לשכת השר יוסף ספיר, 1969-1967
לשכת השר מנחם בגין, 1970-1967
לשכת השר אריה דולצ'ין, 1970-1969
לשכת השרה שולמית אלוני, 1974
לשכת השר חיים לנדאו, 1979-1976

משרד החוץ:
לשכת השר והמנכ"ל, 1979-1948

מחלקות שונות במשרד החוץ:
מחלקת ארצות-הברית, 1956-1948
מחלקת מזרח-אירופה, 1956-1948
מחלקת מערב אירופה, 1956-1948
מחלקת מזרח-תיכון, 1967-1948
מחלקת אמריקה הלטינית, 1956-1948
מחלקת אסיה-אפריקה, 1956-1948
מחלקת חבר-העמים הבריטי, 1956-1948
מחלקת שביתת-הנשק, 1967-1948
המחלקה לארגונים בין-לאומיים, 1979-1948
המחלקה לשיתוף-פעולה בין-לאומי, 1975-1948
המחלקה הכלכלית, 1970-1948
המחלקה המשפטית, 1962-1948
המחלקה הקונסולרית, 1969-1949
מחלקת הצופן, 1968-1948
חומר מדיני, 1957 – 1979
מרכז רשומות ותיעוד (בכירי משרד החוץ), 1937 - 1979
נציגויות ישראל בחוץ-לארץ, 1948 – 1979

משרדי ממשלה שונים – חטיבות מיוחדות:
משרד המיעוטים 1949-1948
המשרד לענייני דתות, מחלקת דתות נוצריות, 1979-1948
המשרד לענייני דתות, המחלקה המוסלמית, 1979-1948
משרד הפנים, אגף המיעוטים, 1965-1948
משרד האוצר, מינהל הדלק, 1960-1948
משרד המסחר והתעשייה, מחלקת סחר חוץ, 1959-1954
משרד המשטרה, לשכת השר בכור שטרית, 1963-1948

משטרת ישראל:
המטה הארצי ותיקי מחוזות, 1973-1948

ארכיונים אישיים:
ארכיון לוי אשכול, 1969-1963
ארכיון גולדה מאיר, 1984-1925 (כולל חומר גלוי)
ארכיון אבא אבן (משרד החוץ), 1977-1948
ארכיון פנחס ספיר, 1975-1949
ארכיון פנחס לבון (כולל "הפרשה"), 1965-1951
ארכיון דב יוסף, 1975-1948
ארכיון יגאל ידין, 1979-1951
אוסף אמנון רובינשטיין, 1978-1976
אוסף זלמן שז"ר, 1974-1938
ארכיון טדי קולק, 1973-1952
ארכיון יעקב הרצוג, 1973-1948
ארכיון ראובן שילוח (משרד החוץ), 1959-1948
ארכיון עו"ד אשר לויצקי, 1959-1922
ארכיון ליאו כהן, 1960-1912 
אוסף אריה סימון, 1949-1945 (המשלחת הישראלית לשיחות על הסכמי שביתת הנשק ברודוס)